La coupe de la Ligue est maintenue dans le calendrier du football français, avec toujours une qualification directe pour l'UEFA Europa League. Elle sera toujours retransmisse sur France Télévisions.

Sur le site de la Ligue, on peut lire ces quelques précisions quant à son organisation.

Dès la prochaine édition, la formule évoluera afin de protéger tous les clubs français engagés en coupes d'Europe. Le FC Girondins de Bordeaux (champion), l'Olympique de Marseille (vice-champion), l'Olympique Lyonnais (3e), le Toulouse FC (4e), le LOSC (5e) et En Avant de Guingamp (vainqueur de la Coupe de France) effectueront leur entrée en lice directement en huitièmes de finale. Les quatre premiers de Ligue 1 à l'issue de la saison 2008/2009 bénéficieront du statut de tête de série en huitièmes et en quarts de finale, ce qui leur évitera de se rencontrer. A partir des demi-finales, le tirage au sort sera intégral.